本土寺（ほんどじ）は、千葉県松戸市平賀にある日蓮宗の寺院。山号は長谷山（ちょうこくさん）。正式名称は長谷山 本土寺。
下総国（現在の千葉県）の日蓮の在家の信者の曽谷教信が法華堂を建立したのが起源。
1277年（建治3年）に日蓮の弟子の日朗が本土寺を開いた。
「本土寺」は、東京都大田区にある池上本門寺や鎌倉市にある比企ヶ谷妙本寺 (鎌倉市)とともに「日朗門流」の有力な寺院。