堀越弘毅（ほりこし こうき、1932年10月28日ー2016年）は、微生物学者。
埼玉県出身。東京大学農学部卒、1963年農学博士。理化学研究所研究員,1988年東京工業大学教授。のち東洋大学教授,海洋研究開発機構極限環境生物フロンティア研究システム長。世界にさきがけて好アルカリ性微生物を発見,深さ1万メートルの深海など極限環境に生きる微生物を多く発見した。2006年「好アルカリ性微生物の発見と,その生理および応用に関する研究」で日本学士院賞受賞。